Outils de recherche en bases de données

Ce site est en cours de développement. Au fur et à mesure des avancées, vous aurez accès à un nombre croissant de fonctions de recherche.

Pour l'instant je vous propose:

• Recherche par masse (unique).
• Peptide mass fingerprinting.
• Analyse de mélanges de protéines (en développement).
• Analyse de mélanges de protéines, algorithme probabiliste (en développement).

Une documentation en ligne est aussi disponible avec quelques informations.

Autres outils

D'autres outils m'ont été demandés. Je les ajoute dans la liste ci-dessous au fur et à mesure:

• Calibration interne à partir d'une liste de masses.
• Calibration interne à partir d'une digestion in silico.
• Comparaison d'une liste de pics à une digestion in silico.
• Comparaison d'une liste de pics à une digestion (avec des modifications fixes).
• Unification de pics de chromatogrammes LC/MS issus d'un fichier CSV.
• Unification de pics de chromatogrammes q-TOF MS après retraitement par PLGS.
• Codage isotopique extrait de retraitements PLGS - TOF MS.
• Recherche de cross-links dans une digestion.
• Recherche de fragments de peptides pontés.
• Recherche de fragments MS/MS à partir d'une séquence connue..
• Recherche de modifications multiples.
• Déplacements de masse suite à une expérience d'échanges H/D.
• Représentation de valeurs sur une séquence (pour échanges H/D ou autre).